阿合馬被殺後獲厚葬，當忽必烈最終了解他作為後，即刻剖棺：「戮屍於通玄門外，縱犬啖其肉。」
古代官員制度，雖然科舉制度的出現及逐步完善，擴寬政府選拔人材基礎，但處於社會下層而有能力的人，都會被拒之門外。不過有一個人例外，他雖身份低賤，但卻的得以為官，一路晉升官至宰相－阿合馬。
影視中的阿合馬
據史載，阿合馬早年生平不詳，只知他是察必皇后的父親按陳那顏的陪嫁奴隸。《元史》載，君主忽必烈當初評他為：「夫宰相者，明天道，察地理，盡人事，兼此三者，乃為稱職。阿里海牙、麥術丁等，亦未可為相，回回人中，阿合馬才任宰相。」可以見得他在忽必烈心中的地位。
阿合馬作為「回回人」，即元朝色目人，在職時主要管理財政，作為忽必烈時的近臣，他在政務上的能力自然出眾。主要成績包括設置諸路轉運司，加強稅收管理，規範納稅制度30分取1，使納稅有章可循，也防止貪官污吏，保障元代商業正常發展。
影視中的阿合馬
此外，阿合馬還大興鐵冶，官營牟利。擴大採冶石絨（即石棉）範圍，並成立專門管理機構，客觀上促進農業及礦業生產。另外推行「鉤考」財政審計制度，由朝廷派員到各地清算錢穀等項，防止豪強隱瞞和官吏貪侵。
事實上，在忽必烈統治初期，朝廷各級官吏沒有俸祿，等於公開讓他們勒索百姓，阿合馬在職時實行官俸制度，故貪污中飽再不合法。還有一點就是，阿合馬推發行紙幣制度，令元代鈔法成為世上最早純紙幣流通制度。
阿合馬這麼多貢獻，但傳統史家對阿合馬評價都相當負面，如《元史》就把阿合馬收錄於《奸臣傳》，有「益肆貪橫」、「內通貨賄，外示刑威」等字眼。這是因為阿合馬濫用職權，為己謀私。
影視中的忽必烈
由於忽必烈更看重阿合馬，到了後來簡直無所不從，也使得阿合馬後期專權越來越厲害。《元史》載，當阿合馬在位時間久了，更肆意貪婪驕橫，竟然拉扯提拔奸黨郝禎、耿仁，一下子遷升到和自己同在中書省任職，陰謀勾結，專門從事蒙蔽皇帝。至於積欠賦稅不加免除，百姓們逃亡遷移，京兆等路每年收入賦稅達到五萬四千錠，還是認為不是實況。
後來，阿合馬愈加猖獗。百姓有近郊良田就搶奪據為己有。暗地接受賄賂，表面上做得執法嚴明，朝中百官互相用眼神表達不滿，但沒有人敢於明白議論。有一個值宿禁衛的秦長卿，激昂慷慨地上書揭發他的種種罪惡，竟被阿合馬謀害，在監獄害死他。秦長卿是這樣評價阿合馬：「……能識阿合馬，其為政擅生殺人，人畏憚之，固莫敢言……其情似秦趙高；私蓄逾公家貲，覬覦非望，其事似漢董卓。」
影視中的阿合馬
後來去到一個地步，甚至朝中大臣大多都彈劾阿合馬專權擅政、貪污腐敗，忽必烈仍然堅信阿合馬，認為回回人中間，阿合馬的才能足以勝任宰相。到了至元十九年（公元1282年），益都千戶武官王著，聯絡僧人高和尚，趁世祖北往上都時，假傳太子之命召喚留守大都的阿合馬，然後設計刺殺阿合馬。
據《元史》載，王著最終被忽必烈所殺，阿合馬反而得到厚葬。忽必烈始終不知阿合馬的種種罪責，直至審問阿合馬的妻兒才了解：「中書毋問其妻子。及詢孛羅，乃盡得其罪惡，始大怒曰：『王著殺之，誠是也。』」這時才知道自己殺錯人，並且被欺騙，憤怒異常，下令戮屍，還將阿合馬團夥剝皮示眾，放狗吃其肉：「乃命發墓剖棺，戮屍於通玄門外，縱犬啖其肉。百官士庶，聚觀稱快。子侄皆伏誅，沒入其家屬財產。」
